In alcuni casi la differenza nella struttura (cioè nel modo in cui gli atomi sono legati) ha conseguenze molto importanti nelle proprietà, tali che i due isomeri appartengono a due classi chimiche diverse.
L’etanolo (o alcol etilico) e il metossimetano (o dimetiletere) sono entrambi costituiti da 2 atomi di C, 6 di idrogeno e 1 di ossigeno, quindi hanno formula molecolare C2H6O e peso molecolare 46.
L’etanolo è un liquido che bolle a 78°C (allo stato liquido la presenza del gruppo OH fa sì che si creino legami idrogeno intermolecolari) e presenta la caratteristica discreta reattività degli alcoli.
Il metossimetano è un gas con punto di ebollizione a -24°C e presenta la caratteristica scarsa reattività degli eteri.
Si tratta di due isomeri strutturali e le loro differenze nelle proprietà chimiche e fisiche possono essere spiegate proprio in base alla diversità della loro struttura.