Fissaidee 1

In ciascun nucleotide degli acidi nucleici, la base azotata è legata al C1' dello zucchero mentre il gruppo fosfato è legato al C5', che è esterno all'anello del desossiribosio. Ogni carbonio dello zucchero è indicato con un numero a cui viene aggiunto un apice, per distinguerli da quelli delle basi azotate di ciascun nucleotide; per esempio il carbonio 1 del desossiribosio viene scritto C1’, che si legge “carbonio 1-primo”. 

I nucleotidi di ciascun filamento sono uniti da legami covalenti tra lo zucchero di un nucleotide e il gruppo fosfato del nucleotide successivo, costituendo lo scheletro zucchero-fosfato. In un filamento di DNA, il fosfato legato all’atomo di carbonio 5’ dello zucchero di un nucleotide è legato al carbonio 3’ dello zucchero appartenente al nucleotide precedente.

Le due estremità libere di ciascun filamento sono indicate come terminale 5’ e terminale 3’. I due filamenti polinucleotidici hanno orientamento antiparallelo tra loro: direzione 5’-3’ uno e 3’-5’ l’altro.